Санаторий «Мерке» находится в 12 км. от районного центра Мерке и располагается в широком Меркенском ущелье Кыргызского Алатау, на высоте 750м над уровнем моря. По дну ущелья протекает бурная речка «Меркенка», на пологих берегах которой широкой лентой произрастают лиственные деревья и кустарники. В теплый период года лесной массив наполнен пением и гомоном самых различных пород птиц.

От села Мерке к санаторию проходит асфальтированная дорога с медленным подъемом в гору, пребывающие больные даже не замечают, что они поднялись к санаторию на высоту семьсот пятьдесят метров. На левом берегу речки на площади около 10 Га располагаются жилые корпуса для больных на 500 мест, лечебные здания, терренкуры, зоны отдыха и помещения для хозяйственных служб. Санаторий работает круглый год. В любой сезон года лечение радоном, проходит благоприятно. Весна в санатории ранняя: быстро сходит снег и горы покрываются бархатным зеленым ковром. Иногда идут грозовые дожди. Летом дожди повторяются немного реже. В знойные дни жара в санатории переносится сравнительно легко: тепло воздуха гасится холодной водой речки и легким ветром, который днем уносит теплый воздух в горы, а ночью приносит прохладу с гор на разогретую землю. Осень сухая, долгая с медленным наступлением заморозков. Зима сопровождается снежным покровом, но без больших морозов. Климатические условия санатория на протяжении всего года позволяют больным заниматься всеми видами климатодвигательного режима и закаливанием организма. Основным лечебным фактором санатория «Мерке» является радоновая минеральная вода. Эта радоновая вода относится к мало минерализованным прохладным, хлоридно-сульфатно-гидрокарбонатным, кальциево-калиево-натриевым. Содержание радона в воде колеблется от 90 до 130 н/к/литр, в зависимомти от времени года, РН воды – 8,2. Минеральная радоновая вода из скважин самоизливается с температурой - 23° градуса, которая подогревается до температуры тела человека (36° - 37°), для отпуска процедур радоновые ванны.