KCSD создана в 1997 году. Является некоммерческой организацией и единственной организацией на территории Республики Казахстан, осуществляющей депозитарную деятельность и ведение системы реестров держателей ценных бумаг. В 2018 году проведена добровольная реорганизация КЦД и АО «Единый регистратор ценных бумаг» в форме присоединения последнего к КЦД.

KCSD осуществляет депозитарную деятельность, отдельные виды банковских операций в национальной и иностранной валютах, клиринговую деятельность, оказывает услуги клиринговым организациям и центральным контрагентам биржевого и внебиржевого рынков, а также ведет систему реестров держателей ценных бумаг.

KCSD является членом авторитетных международных ассоциаций, таких как Ассоциация центральных депозитариев Евразии, Ассоциация национальных нумерационных агентств, Азиатско-Тихоокеанская группа центральных депозитариев ценных бумаг, Международная организация комиссий по ценным бумагам и Европейская ассоциация центральных депозитариев.